INTRODUCAO: A cirurgia renal retrógrada por ureteroscopia flexível (RIRS) é o principal tratamento minimamente invasivo para cálculos renais. A eliminação completa dos cálculos tem sido cada vez mais obtida graças à melhor eficácia dos equipamentos a LASER, aparelho flexíveis mais finos, precisos e com visão digital, materiais descartáveis que oferecem menor trauma, indicações cirúrgicas padronizadas e maior experiência dos profissionais. OBJETIVOS: Avaliar os fatores relacionados à permanência de cálculos renais após tratamento por RIRS. MÉTODO: Este estudo prospectivo analisou 326 pacientes submetidos a tratamento de litíase renal por RIRS. Verificaram-se todos os fatores associados à permanência de cálculos residuais nos rins após uma única sessão terapêutica. Os resultados foram comparados por análises univariadas e multivariadas com significância correspondente a p < 0,05. RESULTADOS E CONCLUSAO: A eliminação completa dos cálculos após uma sessão de RIRS foi obtida em 309 (94,8%) casos. Os principais fatores de risco associados à presença de litíase residual foram o tamanho do cálculo superior a 20 mm e a sua localização em cálice inferior. Pacientes que não estavam em uso de cateter duplo J previamente ao tratamento apresentaram maior taxa de litíase residual. Há risco de litíase residual após cirurgia renal retrógrada por ureteroscopia flexível quando a dimensão do cálculo for superior a 20 mm, sua localização for polar inferior e o paciente não estiver usando cateter duplo J anteriormente à cirurgia.